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“Hacking is believing”的内容更新

累计：145 篇（自 2007-11-01 起）

更新：约3篇/月，最后更新545 天前

Hacking is believing

Rails 3 とGoogle Chart APIを使って7分で、、、に10分で

web+db press vol.58 の rails 3 の記事を参考にしながら、「rails 3 とgoogle chart apiを使って7分ぐらいで発現データベースを作るよ」に検索機能を付けます。今回は少し rails 3 っぽいところが出てきます。rails 3 から採用されたコアライブラリ activemodel を使って検索機能を追加しています。activemodel は簡単に言うと、activerecord のなかで汎用性の高い部分を取り出して... (313 天前)

http://inezha.com/w/qbyi6h7

Hacking is believing

Rails 3 とGoogle Chart APIを使って7分ぐらいで発現デー

以前書いた記事、ruby on rails + gruffを使って、11分で作る遺伝子発現データベースが、すっかり古くなってしまったので rail3 rc で作り直してみました。また以前はグラフ表示に gruff を使っていたのですが、今回は google chart api を使いました。google chart api の url はコピペですまん。覚えれなかった… あとグラフ書くためのurlを出力する部分でバグ出してキョドってる... (313 天前)

http://inezha.com/w/2qrrlhy

Hacking is believing

Google Chart APIでGraphvizが使えるようになっているよ

google chart apiで、グラフ描写ツールである graphviz で使われている dot 言語が使えるようになっています。graphviz charts (experimental) / google chart api以下のような graph が簡単に書けます。このグラフを dot 言語で書くと以下のようになります。digraph loveplus { rankdir=lr; size="8,5" node [shape = doublecircle]; n, i; node [shape = circle]; n -> ... (313 天前)

http://inezha.com/w/8cb8uhx

Hacking is believing

ChromeだとOpenSearchでPubMed検索が簡単にできる

バイオの研究者は、一日のうち何度も pubmed にアクセスするのではないでしょうか? 今までアドレスバーに、pubmed.gov と入力してアクセスしていたのですが、もっと簡単な方法を発見しました。ただし chrome 限定で、一度でも chrome で pubmed にアクセスしたことがあることが条件です。chrome のアドレスバーに puと入力して tab key を入力します。するとアドレスバーが以下のよ... (313 天前)

http://inezha.com/w/okyxrf1

Hacking is believing

Primer3の入力フォーマットが変わったのでeprimer3がエラ

いつからかわからないけど、primer3 の入力フォーマットが微妙に変わったらしい。これまで、入力配列はsequence=atgcagagag...という形で指定していたが、sequence_template=atgcagagag...に変わったらしい。このせいで emboss の eprimer3 が sequence タグを発見できなくて動かない。primer3 のコードをいてみたら、read_boulder.c の以下の箇所がif (compare("sequence... (313 天前)

http://inezha.com/w/j6r52fj

Hacking is believing

ゲノム座標を異なるゲノムバージョンの間で変換するよ

マイクロアレイのアノテーションが古い、などの理由でゲノムのバージョンが古い座標を使ったファイルを使わなければならないときってありますよね? でも新しいゲノムのバージョンで解析しているほかのデータと一緒に見たい!! そんなときに座標を変換する方法を調べてみました。(注: もちろん元のdna配列が得られるなら自分でマップしたほうがいいですよ)ここでは、マウスゲノムの m... (313 天前)

http://inezha.com/w/hmbvbfn

Hacking is believing

Androidで使っているアプリ

ラボでandroidケータイをもっているひとが俺を含めて3人になった。これで iphone ユーザと同等のユーザ数を誇る勢力に! android部発足フラグ!せっかくなのでインストールしているアプリを上げてみた。ほかのお勧めがあったら教えてくださいな。qik (ライブストリームクライアント, ust みたいなもん)fxcamera (トイカメ?ポラ風写真が取れる。ほぼデフォでこれ使っている)vignette... (313 天前)

http://inezha.com/w/g4y3jfg

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